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全部測站共調查 98 種魚類   
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Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Culter alburnus翹嘴鮊 
Anguilliformes鰻形目Ophichthidae蛇鰻科 Lamnostoma mindora明多粗犁鳗 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Redigobius bikolanus拜庫雷鰕虎 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Stiphodon atropurpureus菲律賓枝牙鰕虎 
Perciformes鱸形目Gerreidae鑽嘴魚科 Gerres macracanthus大棘鑽嘴魚 
Perciformes鱸形目Ambassidae雙邊魚科 Parambassis ranga蘭副雙邊魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Aphyocypris kikuchii菊池氏細鯽 
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Cypriniformes鯉形目Cobitidae鰍科 Cobitis sp.高屏花鰍 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Barbonymus gonionotus爪哇鲃 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Rhinogobius delicatus細斑吻鰕虎 
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Cypriniformes鯉形目Balitoridae平鰭鰍科 Sinogastromyzon nantaiensis南台中華爬岩鰍 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Metzia mesembrinum大鱗梅氏鯿 
Perciformes鱸形目Cichlidae慈鯛科 Parachromis managuensis馬拉麗體魚 
Perciformes鱸形目Ambassidae雙邊魚科 Ambassis miops少棘雙邊魚 
Perciformes鱸形目Cichlidae慈鯛科 Cichla ocellaris眼點麗鯛 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Gobiobotia cheni陳氏鰍鮀 
Siluriformes鯰形目Bagridae鮠科 Pseudobagrus adiposalis脂鮠 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Schismatogobius roxasi羅氏裸身鰕虎 
Siluriformes鯰形目Siluridae鯰科 Silurus asotus鯰魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Metzia formosae台灣梅氏鯿