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全部測站共調查 98 種魚類   
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Cypriniformes鯉形目Cobitidae鰍科 Cobitis sp.高屏花鰍 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Cyprinus carpio鯉 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Lentipes armatus棘鱗裂唇鯊 
Perciformes鱸形目Eleotridae塘鱧科 Oxyeleotris marmorata斑駁尖塘鱧 
Anguilliformes鰻形目Anguillidae鰻鱺科 Anguilla japonica日本鰻 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Hemibarbus labeo 
Perciformes鱸形目Cichlidae慈鯛科 Cichla ocellaris眼點麗鯛 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Oligolepis acutipennis斑點寡鱗鰕虎 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Awaous ocellaris厚唇鯊 
Cypriniformes鯉形目Cobitidae鰍科 Misgurnus anguillicaudatus泥鰍 
Perciformes鱸形目Cichlidae慈鯛科 Parachromis managuensis馬拉麗體魚 
Perciformes鱸形目Ambassidae雙邊魚科 Ambassis miops少棘雙邊魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Onychostoma alticorpus高身鏟頜魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Metzia formosae台灣梅氏鯿 
Perciformes鱸形目Rhyacichthyidae溪鱧科 Rhyacichthys aspro溪鱧 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Microphysogobio alticorpus高身小鰾鮈 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Spinibarbus hollandi何氏棘鲃 
Perciformes鱸形目Kuhliidae湯鯉科 Kuhlia rupestris大口湯鯉 
Perciformes鱸形目Centrarchidae太陽魚科 Micropterus salmoides大口黑鱸 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Gobiobotia cheni陳氏鰍鮀