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全部測站共調查 98 種魚類   
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Cypriniformes鯉形目Balitoridae平鰭鰍科 Sinogastromyzon nantaiensis南台中華爬岩鰍 
Siluriformes鯰形目Bagridae鮠科 Pseudobagrus adiposalis脂鮠 
Siluriformes鯰形目Clariidae塘蝨魚科 Clarias batrachus蟾鬍鯰 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Culter alburnus翹嘴鮊 
Anguilliformes鰻形目Ophichthidae蛇鰻科 Lamnostoma mindora明多粗犁鳗 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Redigobius bikolanus拜庫雷鰕虎 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Stiphodon atropurpureus菲律賓枝牙鰕虎 
Perciformes鱸形目Ambassidae雙邊魚科 Parambassis ranga蘭副雙邊魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Barbonymus gonionotus爪哇鲃 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Metzia mesembrinum大鱗梅氏鯿 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Schismatogobius roxasi羅氏裸身鰕虎 
Siluriformes鯰形目Siluridae鯰科 Silurus asotus鯰魚 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Squalidus banarescui巴氏銀鮈 
Perciformes鱸形目Channidae鱧科 Channa asiatica七星鱧 
Perciformes鱸形目Gerreidae鑽嘴魚科 Gerres macracanthus大棘鑽嘴魚 
Anguilliformes鰻形目Anguillidae鰻鱺科 Anguilla bicolor pacifica二色鰻 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Mugilogobius myxodermus黏皮鯔鰕虎 
Cypriniformes鯉形目Cobitidae鰍科 Cobitis sp.高屏花鰍 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Cyprinus carpio鯉 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Lentipes armatus棘鱗裂唇鯊