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全部測站共調查 98 種魚類   
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Siluriformes鯰形目Clariidae塘蝨魚科 Clarias batrachus蟾鬍鯰 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Culter alburnus翹嘴鮊 
Anguilliformes鰻形目Ophichthidae蛇鰻科 Lamnostoma mindora明多粗犁鳗 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Redigobius bikolanus拜庫雷鰕虎 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Rhinogobius henchuenensis恆春吻鰕虎 
14 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Rhinogobius nantaiensis南台吻鰕虎 
31 
Anguilliformes鰻形目Anguillidae鰻鱺科 Anguilla bicolor pacifica二色鰻 
Perciformes鱸形目Cichlidae慈鯛科 Cichlasoma citrinellum紅魔麗體魚 
19 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Mugilogobius myxodermus黏皮鯔鰕虎 
Siluriformes鯰形目Bagridae鮠科 Pseudobagrus brevianalis taiwanensis短臂鮠 
Perciformes鱸形目Kuhliidae湯鯉科 Kuhlia rupestris大口湯鯉 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Puntius snyderi史尼氏小鲃 
20 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Candidia pingtungensis屏東條紋鱲 
13 
Perciformes鱸形目Centrarchidae太陽魚科 Micropterus salmoides大口黑鱸 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Lentipes armatus棘鱗裂唇鯊 
Perciformes鱸形目Channidae鱧科 Channa asiatica七星鱧 
Cypriniformes鯉形目Cyprinidae鯉科 Microphysogobio alticorpus高身小鰾鮈 
Synbranchiformes合鰓魚目Synbranchidae合鰓魚科 Monopterus albus黃鱔 
10 
Anguilliformes鰻形目Anguillidae鰻鱺科 Anguilla japonica日本鰻 
Perciformes鱸形目Gobiidae鰕虎科 Oligolepis acutipennis斑點寡鱗鰕虎